MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 39416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5631	NC_005791	A	6	6	242010	242015	100 %	0 %	0 %	0 %	45357797
5632	NC_005791	GAC	2	6	242081	242086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357797
5633	NC_005791	TAAA	2	8	242157	242164	75 %	25 %	0 %	0 %	45357797
5634	NC_005791	GTT	2	6	242171	242176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357797
5635	NC_005791	ACA	2	6	242232	242237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357797
5636	NC_005791	GAA	2	6	242315	242320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357797
5637	NC_005791	GAAG	2	8	242348	242355	50 %	0 %	50 %	0 %	45357797
5638	NC_005791	TCA	2	6	242378	242383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357797
5639	NC_005791	AC	3	6	242391	242396	50 %	0 %	0 %	50 %	45357797
5640	NC_005791	AAC	2	6	242399	242404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357797
5641	NC_005791	TTC	2	6	242415	242420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357797
5642	NC_005791	CTG	3	9	242427	242435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357797
5643	NC_005791	TAA	2	6	242491	242496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357797
5644	NC_005791	ACA	2	6	242505	242510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357797
5645	NC_005791	TGA	2	6	242521	242526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357797
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5647	NC_005791	AGC	2	6	242617	242622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357797
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5649	NC_005791	TGA	2	6	242633	242638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357797
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5651	NC_005791	AAT	2	6	242685	242690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357798
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5653	NC_005791	AT	3	6	242808	242813	50 %	50 %	0 %	0 %	45357798
5654	NC_005791	A	6	6	242835	242840	100 %	0 %	0 %	0 %	45357798
5655	NC_005791	TGACGA	2	12	242868	242879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357798
5656	NC_005791	GAA	2	6	242881	242886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357798
5657	NC_005791	AGGA	2	8	242942	242949	50 %	0 %	50 %	0 %	45357798
5658	NC_005791	TCC	2	6	242958	242963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45357798
5659	NC_005791	GAC	2	6	243028	243033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357798
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5661	NC_005791	GAC	2	6	243043	243048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357798
5662	NC_005791	AAAAC	2	10	243094	243103	80 %	0 %	0 %	20 %	45357798
5663	NC_005791	AAT	2	6	243120	243125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357798
5664	NC_005791	A	6	6	243136	243141	100 %	0 %	0 %	0 %	45357798
5665	NC_005791	CAA	2	6	243353	243358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357798
5666	NC_005791	AC	3	6	243368	243373	50 %	0 %	0 %	50 %	45357798
5667	NC_005791	TA	3	6	243434	243439	50 %	50 %	0 %	0 %	45357798
5668	NC_005791	TCA	2	6	243445	243450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357798
5669	NC_005791	GAA	3	9	243493	243501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357798
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5671	NC_005791	CTT	2	6	243610	243615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357799
5672	NC_005791	GTT	2	6	243622	243627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357799
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5674	NC_005791	TTCT	2	8	243734	243741	0 %	75 %	0 %	25 %	45357799
5675	NC_005791	AT	3	6	243842	243847	50 %	50 %	0 %	0 %	45357799
5676	NC_005791	CTT	2	6	243890	243895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357799
5677	NC_005791	A	6	6	243959	243964	100 %	0 %	0 %	0 %	45357799
5678	NC_005791	CTG	2	6	244074	244079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357800
5679	NC_005791	ACTAT	2	10	244182	244191	40 %	40 %	0 %	20 %	45357800
5680	NC_005791	AAAT	2	8	244201	244208	75 %	25 %	0 %	0 %	45357800
5681	NC_005791	TAA	2	6	244288	244293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357800
5682	NC_005791	AGATG	2	10	244366	244375	40 %	20 %	40 %	0 %	45357800
5683	NC_005791	AATTTT	2	12	244393	244404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357800
5684	NC_005791	CAT	2	6	244422	244427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5685	NC_005791	TCA	2	6	244511	244516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357801
5686	NC_005791	CCAC	2	8	244554	244561	25 %	0 %	0 %	75 %	45357801
5687	NC_005791	TAA	2	6	244588	244593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357801
5688	NC_005791	AT	4	8	244609	244616	50 %	50 %	0 %	0 %	45357801
5689	NC_005791	AT	3	6	244662	244667	50 %	50 %	0 %	0 %	45357801
5690	NC_005791	TCCC	2	8	244785	244792	0 %	25 %	0 %	75 %	45357801
5691	NC_005791	GA	3	6	244816	244821	50 %	0 %	50 %	0 %	45357801
5692	NC_005791	T	6	6	244879	244884	0 %	100 %	0 %	0 %	45357801
5693	NC_005791	TGA	2	6	244911	244916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357801
5694	NC_005791	A	8	8	244916	244923	100 %	0 %	0 %	0 %	45357801
5695	NC_005791	A	6	6	244959	244964	100 %	0 %	0 %	0 %	45357802
5696	NC_005791	AT	4	8	244967	244974	50 %	50 %	0 %	0 %	45357802
5697	NC_005791	AC	3	6	245043	245048	50 %	0 %	0 %	50 %	45357802
5698	NC_005791	TGA	2	6	245159	245164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357802
5699	NC_005791	A	7	7	245211	245217	100 %	0 %	0 %	0 %	45357802
5700	NC_005791	TTA	2	6	245270	245275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357802
5701	NC_005791	GGGTT	2	10	245305	245314	0 %	40 %	60 %	0 %	45357802
5702	NC_005791	TATCGA	2	12	245324	245335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357802
5703	NC_005791	ATT	2	6	245359	245364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357802
5704	NC_005791	A	7	7	245389	245395	100 %	0 %	0 %	0 %	45357802
5705	NC_005791	ATT	2	6	245419	245424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357802
5706	NC_005791	ATA	2	6	245434	245439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357802
5707	NC_005791	TC	3	6	245440	245445	0 %	50 %	0 %	50 %	45357802
5708	NC_005791	TTC	2	6	245516	245521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357802
5709	NC_005791	ATG	2	6	245554	245559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357802
5710	NC_005791	ATAC	2	8	245620	245627	50 %	25 %	0 %	25 %	45357802
5711	NC_005791	CTT	2	6	245635	245640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357802
5712	NC_005791	ATT	2	6	245660	245665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357802
5713	NC_005791	AGT	2	6	245785	245790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357802
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5715	NC_005791	CTT	2	6	245986	245991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357803
5716	NC_005791	AGT	2	6	246039	246044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357803
5717	NC_005791	TGA	2	6	246102	246107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357803
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5720	NC_005791	GAAT	2	8	246171	246178	50 %	25 %	25 %	0 %	45357803
5721	NC_005791	TAT	2	6	246277	246282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357803
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5724	NC_005791	TGA	2	6	246374	246379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357804
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5729	NC_005791	TAT	2	6	246565	246570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357804
5730	NC_005791	A	6	6	246645	246650	100 %	0 %	0 %	0 %	45357804
5731	NC_005791	TTC	2	6	246657	246662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357804
5732	NC_005791	ATATG	2	10	246666	246675	40 %	40 %	20 %	0 %	45357804
5733	NC_005791	TAC	2	6	246748	246753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357804
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5735	NC_005791	AAAT	2	8	246863	246870	75 %	25 %	0 %	0 %	45357804
5736	NC_005791	GGT	2	6	246903	246908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45357804
5737	NC_005791	ACTGAT	2	12	246913	246924	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357804
5738	NC_005791	ATA	2	6	246941	246946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357804
5739	NC_005791	GAATT	2	10	246956	246965	40 %	40 %	20 %	0 %	45357804
5740	NC_005791	TGA	2	6	246969	246974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357804
5741	NC_005791	ATG	2	6	247016	247021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357804
5742	NC_005791	A	6	6	247024	247029	100 %	0 %	0 %	0 %	45357804
5743	NC_005791	ACT	2	6	247057	247062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357804
5744	NC_005791	AATT	2	8	247065	247072	50 %	50 %	0 %	0 %	45357804
5745	NC_005791	ACT	2	6	247084	247089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357804
5746	NC_005791	TTA	2	6	247231	247236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357804
5747	NC_005791	A	6	6	247253	247258	100 %	0 %	0 %	0 %	45357804
5748	NC_005791	TATGA	2	10	247306	247315	40 %	40 %	20 %	0 %	45357804
5749	NC_005791	ATT	2	6	247319	247324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357804
5750	NC_005791	TAA	2	6	247362	247367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357804
5751	NC_005791	T	6	6	247405	247410	0 %	100 %	0 %	0 %	45357804
5752	NC_005791	ATTCGG	2	12	247505	247516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45357804
5753	NC_005791	GAAT	2	8	247566	247573	50 %	25 %	25 %	0 %	45357804
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5755	NC_005791	TAC	2	6	247651	247656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357804
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